“進(jìn)化是生命的標(biāo)志”——由基因突變和自然環(huán)境選擇共同編織的漫長史詩。在當(dāng)今的生命科學(xué)領(lǐng)域,我們正嘗試通過定向進(jìn)化,來模仿并加速這一過程。
那么,如何加速這一進(jìn)化過程?答案就藏在基因突變文庫中。
Trimer組合突變文庫以氨基酸作為一個單元進(jìn)行突變,以擴(kuò)大突變范圍。通過針對序列進(jìn)行設(shè)計,可以靈活指定氨基酸的種類和比例,避免不必要的同義密碼子和氨基酸,解決了密碼子偏移、移碼突變和控制終止密碼子摻入等問題,同時顯著提高了文庫的均一性、覆蓋性和多樣性。
定點(diǎn)飽和突變文庫(Site-Saturation Mutagenesis Library)和Trimer組合突變文庫(Combinatorial Mutagenesis Library)是兩種各具特色的工具。前者實(shí)現(xiàn)單點(diǎn)氨基酸的精確突變,后者實(shí)現(xiàn)多點(diǎn)多種氨基酸的精確突變。它們?nèi)缤M(jìn)化的加速器,讓我們能夠更精準(zhǔn)、更高效地探索生命的奧秘。
定制化突變文庫的應(yīng)用
蛋白定向進(jìn)化
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蛋白質(zhì)工程:通過精確調(diào)控目標(biāo)蛋白關(guān)鍵氨基酸的突變,構(gòu)建具有特定功能或性質(zhì)的蛋白質(zhì)變體,調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)活性、穩(wěn)定性和親和性,以適應(yīng)不同應(yīng)用場景需求。
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新功能發(fā)現(xiàn):引入多樣氨基酸變異以發(fā)現(xiàn)新蛋白功能,如催化新反應(yīng)、結(jié)合新配體等,促進(jìn)蛋白功能性篩選和進(jìn)化。
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抗藥性研究:模擬藥物壓力可篩選對抗藥物具耐受性的突變體,揭示藥物抗性機(jī)制,為優(yōu)化藥物治療提供指導(dǎo)。
抗體開發(fā)
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增強(qiáng)親和力:引入特定氨基酸變異可改變抗體與靶標(biāo)分子結(jié)合親和力,提高治療效果和選擇性。
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改善穩(wěn)定性:調(diào)整抗體結(jié)構(gòu)可增強(qiáng)體內(nèi)穩(wěn)定性和半衰期,延長藥效持續(xù)時間、減少劑量頻率,提高患者治療便利性。
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降低免疫原性:避免或減少抗體與人類免疫系統(tǒng)相抗原的位點(diǎn),降低免疫原性和產(chǎn)生不良反應(yīng)風(fēng)險,使抗體更適合臨床治療。
藥物靶點(diǎn)篩選
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靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn):精準(zhǔn)控制和定向突變已知靶點(diǎn)特定區(qū)域,產(chǎn)生具有新結(jié)構(gòu)和功能特性的變體,為新藥物靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)提供工具和平臺。
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靶點(diǎn)驗(yàn)證:整突變體中各氨基酸比例和組合,覆蓋和測試多種功能性質(zhì),全面評估不同突變體的活性、親和性、穩(wěn)定性等重要性質(zhì)。
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藥物篩選:高通量篩選大量不同序列蛋白質(zhì)變體,找到與特定藥物高親和力的靶點(diǎn),加速藥物篩選,提高藥物發(fā)現(xiàn)效率。
泓迅生物領(lǐng)先設(shè)計和先進(jìn)制造提供Trimer文庫一站式解決方案,已成功交付了數(shù)百個高品質(zhì)、定制化的突變文庫。精準(zhǔn)控制CDR區(qū)域的每個突變位點(diǎn),調(diào)整氨基酸種類和比例,提升文庫的準(zhǔn)確度和實(shí)驗(yàn)的成功率,正確率最高可達(dá)90%以上。降低后期篩選難度,節(jié)省時間和精力,享受高性價比服務(wù)。
References
[1] Prassler, Josef, et al. "HuCAL PLATINUM, a synthetic Fab library optimized for sequence diversity and superior performance in mammalian expression systems." Journal of molecular biology 413.1 (2011): 261-278.
[2] Chembath, Anupama, et al. "Nondegenerate Saturation Mutagenesis: Library Construction and Analysis via MAX and ProxiMAX Randomization." Directed Evolution: Methods and Protocols. New York, NY: Springer US, 2022. 19-41.