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人類CRISPR文庫(kù)

泓迅生物專注于CRISPR基因編輯技術(shù)的研究工作，不斷提升服務(wù)和產(chǎn)品的供應(yīng)能力，在定制化CRISPR文庫(kù)構(gòu)建的基礎(chǔ)上，推出Syno^?人類CRISPR文庫(kù)成品，領(lǐng)先的設(shè)計(jì)和規(guī)范化的文庫(kù)構(gòu)建實(shí)現(xiàn)高質(zhì)量交付，降低客戶的研究成本，縮短產(chǎn)品交付周期。高質(zhì)量人類CRISPR文庫(kù)成品助力基因功能研究、藥物開發(fā)、分子診斷、分子育種等領(lǐng)域。

產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)

設(shè)計(jì)出具有高靶向活性和低脫靶率的sgRNA序列
構(gòu)建的文庫(kù)覆蓋率>99.9%，均一性<10
具備Puro藥篩功能，可進(jìn)行慢病毒包裝，提高轉(zhuǎn)染效率
高編輯效率CRISPR文庫(kù)，減輕后期篩選工作的難度，降低研究成本
提供NGS驗(yàn)證、病毒包裝、生信分析等定制化的服務(wù)

產(chǎn)品列表

? Syno^?人類全基因組CRISPR敲除文庫(kù)

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Syno^?人類全基因組CRISPR敲除文庫(kù)由三個(gè)獨(dú)立子庫(kù)A、B、C組成，A和B文庫(kù)分別針對(duì)18,913和18,334個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因。子庫(kù)A包含根據(jù)設(shè)計(jì)標(biāo)準(zhǔn)排名最好的sgRNA，在較低的文庫(kù)覆蓋率下實(shí)現(xiàn)高質(zhì)量的篩選。子庫(kù)B包含第二層sgRNA，當(dāng)需要更高的sgRNA覆蓋率時(shí)，可以用來補(bǔ)充子庫(kù)A。

子庫(kù)C是通過整合大規(guī)模CRISPR篩選的標(biāo)準(zhǔn)化資源，以及多個(gè)效率指標(biāo)，對(duì)廣泛采用的CRISPR文庫(kù)中的300,000多個(gè)特有的sgRNA進(jìn)行評(píng)估和排序，設(shè)計(jì)出了一個(gè)優(yōu)化的人類最小全基因組敲除文庫(kù)。子庫(kù)C的大小比目前公開的人類全基因組CRISPR文庫(kù)均小。雖然子庫(kù)C較小但是并不影響對(duì)必須基因的識(shí)別，多用于復(fù)雜條件下癌癥細(xì)胞模型的CRISPR篩選。

產(chǎn)品編號(hào)	產(chǎn)品名稱	序列信息	載體信息	價(jià)格（元）	規(guī)格
STCRI211101	Syno^?人類全基因組 CRISPR敲除文庫(kù) (Human Genome CRISPR Knockout Libraries)	子庫(kù)A：靶向18,913個(gè)基因，設(shè)計(jì)74,552個(gè)sgRNA序列和435個(gè)對(duì)照（非靶向）sgRNA序列，合計(jì)74,987個(gè)sgRNA序列。	pLentiCRISPR v2-Puro （單質(zhì)粒系統(tǒng)） pLentiGuide-Puro (雙質(zhì)粒系統(tǒng)) pLentiGuide-Puro-GFP (雙質(zhì)粒系統(tǒng))	咨詢	200μg
STCRI211102		子庫(kù)B：靶向18,334個(gè)基因，設(shè)計(jì)71,048個(gè)sgRNA序列和435個(gè)對(duì)照（非靶向）sgRNA序列，合計(jì)71,483個(gè)sgRNA序列。	pLentiCRISPR v2-Puro （單質(zhì)粒系統(tǒng)） pLentiGuide-Puro (雙質(zhì)粒系統(tǒng)) pLentiGuide-Puro-GFP (雙質(zhì)粒系統(tǒng))	咨詢	200μg
STCRI211103		子庫(kù)C：靶向18,761個(gè)基因，設(shè)計(jì)37,522個(gè)sgRNA序列和200個(gè)對(duì)照（非靶向）sgRNA序列，合計(jì)37,722個(gè)sgRNA序列。	pLentiCRISPR v2-Puro （單質(zhì)粒系統(tǒng)） pLentiGuide-Puro (雙質(zhì)粒系統(tǒng)) pLentiGuide-Puro-GFP (雙質(zhì)粒系統(tǒng))	咨詢	200μg

? Syno^?人類全基因組敲除陰性對(duì)照庫(kù)

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Syno^?人類全基因組敲除陰性對(duì)照庫(kù)可作為人全基因組CRISPR sgRNA文庫(kù)的陰性對(duì)照，適用于人類細(xì)胞下的實(shí)驗(yàn)。

產(chǎn)品編號(hào)	產(chǎn)品名稱	序列信息	載體信息	價(jià)格（元）	規(guī)格
STCRI24301	Syno^?人類全基因組敲除陰性對(duì)照庫(kù) (Human Genome Knockout Negative Control Library)	20個(gè)對(duì)照（非靶向）sgRNA序列，sgRNA大小20 bp。	pLentiCRISPR v2-Puro （單質(zhì)粒系統(tǒng)）	咨詢	150μg
STCRI24302		50個(gè)對(duì)照（非靶向）sgRNA序列，sgRNA大小20 bp。	pLentiCRISPR v2-Puro （單質(zhì)粒系統(tǒng)）	咨詢	150μg
STCRI24303		100個(gè)對(duì)照（非靶向）sgRNA序列，sgRNA大小20 bp。	pLentiCRISPR v2-Puro （單質(zhì)粒系統(tǒng)）	咨詢	150μg
STCRI24304		200個(gè)對(duì)照（非靶向）sgRNA序列，sgRNA大小20 bp。	pLentiCRISPR v2-Puro （單質(zhì)粒系統(tǒng)）	咨詢	150μg
STCRI24305		500個(gè)對(duì)照（非靶向）sgRNA序列，sgRNA大小20 bp。	pLentiCRISPR v2-Puro （單質(zhì)粒系統(tǒng)）	咨詢	150μg
STCRI24306		1000個(gè)對(duì)照（非靶向）sgRNA序列，sgRNA大小20 bp。	pLentiCRISPR v2-Puro （單質(zhì)粒系統(tǒng)）	咨詢	150μg
STCRI24307		2000個(gè)對(duì)照（非靶向）sgRNA序列，sgRNA大小20 bp。	pLentiCRISPR v2-Puro （單質(zhì)粒系統(tǒng)）	咨詢	150μg

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? Syno^?人類全基因組CRISPR激活文庫(kù)

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產(chǎn)品編號(hào)	產(chǎn)品名稱	序列信息	載體信息	價(jià)格（元）	規(guī)格
STCRI233301	Syno^?人類全基因組 CRISPR激活文庫(kù) (Human Genome CRISPR Activation Library)	子庫(kù)A：靶向18,885個(gè)基因，設(shè)計(jì)56,266個(gè)sgRNA序列和496個(gè)對(duì)照（非靶向）sgRNA序列，sgRNA大小20 bp。	Syn-pXPR_502 （雙質(zhì)粒系統(tǒng)）	咨詢	200μg
STCRI233302	子庫(kù)B：靶向18,843個(gè)基因，設(shè)計(jì)55,980個(gè)sgRNA序列和496個(gè)對(duì)照（非靶向）sgRNA序列，sgRNA大小20 bp。	Syn-pXPR_502 （雙質(zhì)粒系統(tǒng)）	咨詢	200μg

? Syno^?人類膜蛋白CRISPR激活文庫(kù)

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產(chǎn)品編號(hào)	產(chǎn)品名稱	序列信息	載體信息	價(jià)格（元）	規(guī)格
STCRI113345	Syno^?人類膜蛋白 CRISPR激活文庫(kù) (Human Membrane Protein CRISPR Activation Library)	靶向6,213個(gè)基因的啟動(dòng)子，設(shè)計(jì)58,071個(gè)sgRNA序列和500個(gè)對(duì)照（非靶向）sgRNA序列，合計(jì)58,571個(gè)sgRNA序列。	pKVL2-U6gRNA_ SAM(BbsI)-PGKpuroBFP-W	咨詢	200μg

? Syno^?人源通路 sgRNA文庫(kù)（常見通路）

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代謝過程	文庫(kù)編號(hào)	通路名稱	載體	基因數(shù)目
常見通路（現(xiàn)貨）	SHPF231311	ABC transporter pathway	Lentisyn005	100
	SHPF231312	Acute myeloid leukemia pathway		45
	SHPF231313	Adipogenesis pathway		126
	SHPF231314	Adult stem cell pathway		58
	SHPF231315	Angiogenesis pathway		92
	SHPF231316	Apoptosis pathway		68
	SHPF231317	cAMP&Ca pathway		91
	SHPF231318	Cell cycle pathway		84
	SHPF231319	Chemokine pathway		134
	SHPF231320	Drug Resistance pathway		348
	SHPF231321	ES differentiation pathway		334
	SHPF231322	GPCR pathway		280
	SHPF231323	Hormone activity pathway		108
	SHPF231324	Ion channel pathway		67
	SHPF231325	P450 pathway		57
	SHPF231326	Tumor metastasis pathway		60
	SHPF231327	Tumor suppressor pathway		720
	SHPF231328	Neelamegham human glycogene pathway		347
	SHPF231329	Human mTORC1 pathway		713
	SHPF231330	Pan druggable library
	SHPF241401	Human brunello kinome pooled library		763
	SHPF241402	KinKinases, phosphatases, and drug targets CRISPRi library	pCRISPRia-v2 （no Cas9）	2318

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? Syno^?人源通路sgRNA文庫(kù)（DNA復(fù)制與修復(fù)）

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代謝過程	文庫(kù)編號(hào)	通路名稱	載體	基因數(shù)目
DNA復(fù)制與修復(fù)	SHPF231001	Base excision repair	Lentisyn005	33
SHPF231002	DNA replication	36
SHPF231003	Fanconi anemia pathway	54
SHPF231004	Homologous recombination	41
SHPF231005	Mismatch repair	23
SHPF231006	Non-homologous end-joining	13
SHPF231007	Nucleotide excision repair	47

? Syno^?人源通路sgRNA文庫(kù)（轉(zhuǎn)錄&翻譯）

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代謝過程	文庫(kù)編號(hào)	通路名稱	載體	基因數(shù)目
轉(zhuǎn)錄	SHPF232001	Basal transcription factors	Lentisyn005	45
SHPF232002	RNA polymerase	34
SHPF232003	Spliceosome	154
翻譯	SHPF233001	Aminoacyl-tRNA biosynthesis	66
SHPF233002	mRNA surveillance pathway	97
SHPF233003	Nucleocytoplasmic pathway	108
SHPF233004	Ribosome biogenesis in eukaryotes	118
SHPF233005	Ribosome	167

? Syno^?人源通路sgRNA文庫(kù)（運(yùn)輸與分解代謝）

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代謝過程	文庫(kù)編號(hào)	通路名稱	載體	基因數(shù)目
運(yùn)輸與分解代謝	SHPF234001	Autophagy	Lentisyn005	141
SHPF234002	Endocytosis	251
SHPF234003	Lysosome	132
SHPF234004	Mitophagy	72
SHPF234005	Peroxisome	82
SHPF234006	Phagosome	152

? Syno^?人源通路sgRNA文庫(kù)（細(xì)胞群落&死亡&運(yùn)動(dòng)）

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代謝過程	文庫(kù)編號(hào)	通路名稱	載體	基因數(shù)目
細(xì)胞群落	SHPF235001	Adherens junction	Lentisyn005	71
SHPF235002	Focal adhesion	201
SHPF235003	Gap junction	88
SHPF235004	Signaling pathways regulating pluripotency of stem cells	143
SHPF235005	Tight junction	169
細(xì)胞死亡	SHPF236001	Apoptosis	136
SHPF236002	Cell cycle	127
SHPF236003	Cellular senescence	156
SHPF236004	Ferroptosis	41
SHPF236005	Necroptosis	159
SHPF236006	Oocyte meiosis	131
SHPF236007	p53 signaling pathway	73
細(xì)胞運(yùn)動(dòng)	SHPF236101	Regulation of actin cytoskeleton	229

? Syno^?人源通路sgRNA文庫(kù)（折疊，分選及降解）

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代謝過程	文庫(kù)編號(hào)	通路名稱	載體	基因數(shù)目
折疊，分選及降解	SHPF237001	Proteasome	Lentisyn005	46
SHPF237002	Protein export	23
SHPF237003	Protein processing in endoplasmic reticulum	171
SHPF237004	RNA degradation	79
SHPF237005	SNARE interactions in vesicular transport	33
SHPF237006	Sulfur relay system	8
SHPF237007	Ubiquitin mediated proteolysis	142

? Syno^?人源通路sgRNA文庫(kù)（生長(zhǎng)與再生&信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)）

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代謝過程	文庫(kù)編號(hào)	通路名稱	載體	基因數(shù)目
生長(zhǎng)與再生	SHPF238001	Axon guidance	Lentisyn005	182
生長(zhǎng)與再生	SHPF238002	Osteoclast differentiation		128
信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)	SHPF239001	AMPK signaling pathway		121
	SHPF239002	Apelin signaling pathway		139
	SHPF239003	Calcium signaling pathway		240
	SHPF239004	cAMP signaling pathway		225
	SHPF239005	cGMP-PKG signaling pathway		167
	SHPF239006	ErbB signaling pathway		85
	SHPF239007	FoxO signaling pathway		131
	SHPF239008	Hedgehog signaling pathway		56
	SHPF239009	HIF-1 signaling pathway		109
	SHPF239010	Hippo signaling pathway		157
	SHPF239011	JAK-STAT signaling pathway		166
	SHPF239012	MAPK signaling pathway		294
	SHPF239013	mTOR signaling pathway		156
	SHPF239014	NF-kappa B signaling pathway		104
	SHPF239015	Notch signaling pathway		59
	SHPF239016	Phosphatidylinositol signaling system		97
	SHPF239017	Phospholipase D signaling pathway		148
	SHPF239018	PI3K-Akt signaling pathway		354
	SHPF239019	Rap1 signaling pathway		210
	SHPF239020	Ras signaling pathway		236
	SHPF239021	Sphingolipid signaling pathway		119
	SHPF239022	TGF-beta signaling pathway		95
	SHPF239023	TNF signaling pathway		114
	SHPF239024	VEGF signaling pathway		59
	SHPF239025	Wnt signaling pathway		170

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? Syno^?人源通路sgRNA文庫(kù)（信號(hào)分子與互作）

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代謝過程	文庫(kù)編號(hào)	通路名稱	載體	基因數(shù)目
信號(hào)分子與互作	SHPF231011	Cell adhesion molecules	Lentisyn005	157
SHPF231012	Cytokine-cytokine receptor interaction	295
SHPF231013	ECM-receptor interaction	88
SHPF231014	Neuroactive ligand-receptor interaction	367
SHPF231015	Viral protein interaction with cytokine and cytokine receptor	100

? Syno^?人源通路sgRNA文庫(kù)（循環(huán)系統(tǒng)）

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代謝過程	文庫(kù)編號(hào)	通路名稱	載體	基因數(shù)目
循環(huán)系統(tǒng)	SHPF231111	Adrenergic signaling in cardiomyocytes	Lentisyn005	154
SHPF231112	Cardiac muscle contraction	87
SHPF231113	Vascular smooth muscle contraction	134

? Syno^?人源通路sgRNA文庫(kù)（免疫系統(tǒng)）

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代謝過程	文庫(kù)編號(hào)	通路名稱	載體	基因數(shù)目
免疫系統(tǒng)	SHPF231211	Antigen processing and presentation	Lentisyn005	78
	SHPF231212	B cell receptor signaling pathway		82
	SHPF231213	Chenokine signaling pathway		192
	SHPF231214	Complement and coagulation cascades		86
	SHPF231215	C-type lectin receptor signaling pathway		104
	SHPF231216	Cytosolic DNA-sensing pathway		66
	SHPF231217	Fc epsilon RI signaling pathway		68
	SHPF231218	Fc ganna R-mediated phagocytosis		97
	SHPF231219	Hematopoietic cell lineage		99
	SHPF231220	IL-17 signaling pathway		94
	SHPF231221	Intestinal immune network for IgA production		49
	SHPF231222	Leukocyte transendothelial migration		114
	SHPF231223	Natural killer cell mediated cytotoxicity		132
	SHPF231224	Neutrophil extracellular trap formation		190
	SHPF231225	NOD-like receptor signaling pathway		186
	SHPF231226	Platelet activation		124
	SHPF231227	RIG-I-like receptor signaling pathway		71
	SHPF231228	T cell receptor signaling pathway		104
	SHPF231229	Th1 and Th2 cell differntiation		92
	SHPF231230	Th17 cell differentiation		108
	SHPF231231	Toll-like receptor signaling pathway		104

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常見問題

如何判斷是否要選用Syno^?人源通路 sgRNA文庫(kù)？

目前，市面上大多使用的是人基因組sgRNA文庫(kù)，利用基因組sgRNA文庫(kù)的篩選所得結(jié)果更為廣譜但實(shí)驗(yàn)工程量大。而Syno^?人源通路文庫(kù)具有以下特點(diǎn)：

1、基因總數(shù)少，sgRNA文庫(kù)庫(kù)容小，減少實(shí)驗(yàn)工程量及周期

2、Syno^?人源通路 sgRNA文庫(kù)使用目的性強(qiáng)，一般是在已知基因范圍內(nèi)進(jìn)行靶標(biāo)篩選

3、可以選擇多個(gè)pathway同時(shí)進(jìn)行研究

因此，使用Syno^?人源通路 sgRNA文庫(kù)前要清楚自己研究目的及通路基因，根據(jù)需求進(jìn)行選擇單條通路或多條通路sgRNA文庫(kù)組合。

目前交付內(nèi)容有混合池和陣列板式兩種形式，這兩種有什么區(qū)別嗎？

混合池是所有sgRNA質(zhì)粒混合在一起，是默認(rèn)的發(fā)貨形式，客戶可以直接用來轉(zhuǎn)染細(xì)胞或進(jìn)行慢病毒包裝；陣列板式屬于特色定制化服務(wù)，根據(jù)客戶需求將每種sgRNA質(zhì)粒置于單孔中，呈現(xiàn)陣列式分布以實(shí)現(xiàn)客戶對(duì)文庫(kù)的靈活運(yùn)用。

如何選擇對(duì)應(yīng)的特定通路來滿足實(shí)驗(yàn)需要？

每個(gè)通路文庫(kù)都有一個(gè)根據(jù)基因群功能而的來名稱，根據(jù)名稱判斷所需文庫(kù)；大部分通路文庫(kù)都根據(jù)參與的生物學(xué)過程進(jìn)一步劃分如DNA復(fù)制與修復(fù)過程里有7個(gè)通路文庫(kù)，也可根據(jù)生物學(xué)過程進(jìn)行選擇。

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