DNA 合成的長(zhǎng)度對(duì)于生物技術(shù)的應(yīng)用場(chǎng)景及價(jià)值有著至關(guān)重要的影響。小于 10Kb 片段基因合成主要用于小規(guī)模生物改造;基因組水平的研究應(yīng)用,涉及基因序列長(zhǎng)度一般在 10-500Kb;對(duì)于更復(fù)雜的基因組設(shè)計(jì),基因合成的長(zhǎng)度需求達(dá)到 Mb 級(jí)別。新生命體系的從頭設(shè)計(jì)與合成不僅需要大片段的 DNA,還需要通過(guò)后續(xù)的組裝與拼接獲取完整的基因組,這對(duì) DNA 合成的需求量與性能提出了更高的要求。
DNA合成組裝的難點(diǎn)與挑戰(zhàn)
DNA合成組裝的準(zhǔn)確性與連接效率、拼接次數(shù)密切相關(guān)。使用短初始片段組裝染色體或基因組長(zhǎng)度DNA所需的分層組裝次數(shù)較多,過(guò)程中所需的克隆挑選和測(cè)序等質(zhì)控成本也會(huì)相應(yīng)增加。此外,組裝過(guò)程中需要進(jìn)一步克服聚合序列、長(zhǎng)重復(fù)序列和非規(guī)范的DNA結(jié)構(gòu)對(duì)組裝的抑制作用。大片段DNA合成組裝(>10Kb)是目前基因合成領(lǐng)域技術(shù)開發(fā)的重難點(diǎn)之一,如何降低合成錯(cuò)誤率及成本是主要挑戰(zhàn)!
隨著技術(shù)的跟新,通過(guò)計(jì)算機(jī)算法對(duì)影響組裝的問(wèn)題序列進(jìn)行拆分和序列轉(zhuǎn)換,發(fā)展智能組裝技術(shù),有助于解決復(fù)雜長(zhǎng)片段DNA的組裝難題,提高合成效率、降低成本。
DNA合成技術(shù)
泓迅科技—DNA合成與組裝解決方案
泓迅科技Syno?GS平臺(tái)擁有全面的基因合成與組裝技術(shù),針對(duì) “長(zhǎng)難基因”因難施策,我們自主研發(fā)Complex Index(CI)、NGCodonTM、AI-TAT、DNA StudioTM等多款生物智能分析工具,與自有專利試劑Syno?Interlinkage 、Syno?Assembly 相結(jié)合,推動(dòng)DNA合成向著更加智能化、精準(zhǔn)化和快速化方向發(fā)展。我們?cè)潞铣赏可先f(wàn)條序列,單一DNA片段長(zhǎng)度可達(dá)150Kb,覆蓋從簡(jiǎn)單的DNA片段到復(fù)雜長(zhǎng)DNA組裝,代謝通路及基因組合成,交付成功率100%!
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我們以高效、精準(zhǔn)、低成本方式生產(chǎn)各種DNA,覆蓋從簡(jiǎn)單的DNA 片段到復(fù)雜長(zhǎng)DNA組裝,代謝通路及基因組合成。
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參考文獻(xiàn):
[1] 馮淼,王麗娜,汪保衛(wèi)等.工業(yè)生物技術(shù)中DNA合成發(fā)展現(xiàn)狀及展望[J].生物工程學(xué)報(bào),2022,38(11):4115-4131.
彭凱,逯曉云,程健等.DNA合成、組裝與糾錯(cuò)技術(shù)研究進(jìn)展[J].合成生物學(xué),2020,1(06):697-708.
[2] Jiang XE, Wang Y, Shen Y. The review of DNA synthesis technologies and instruments development [J]. Journal of Integration Technology, 2021, 10(5): 80-95.
[3] 彭凱,逯曉云,程健等.DNA合成、組裝與糾錯(cuò)技術(shù)研究進(jìn)展[J].合成生物學(xué),2020,1(06):697-708.
[4] Hughes RA, Ellington AD. Synthetic DNA Synthesis and Assembly: Putting the Synthetic in Synthetic Biology. Cold Spring Harb Perspect Biol. 2017 Jan 3;9(1):a023812.